1、拟定长江干线航道发展战略，编制中长期规划和五年计划。
2、负责航道生产计划、基本建设计划和船舶购置计划的编制与管理。
3、负责长江航道前期工作的管理
4、负责长江航道整治工程及综合性基础设施建设的前期工作；
　（1）负责项目前期工作的质量和进度；
　（2）负责编制项目建设书和可行性研究报告；
　（3）负责组织建设项目前期阶段成果的审查；
　（4）负责组织长江航道治理工程前期工作中合同签订工作；
5、负责与项目有关的外部协调（工可前）及上报项目的催批工作；
6、负责掌握与航道有关的三峡工程建设、运行等情况，收集三峡工程与航道有关的技术资料；组织三峡航道科研工作；
7、负责长江航道整治工程及综合性基础设施建设竣工后的评价。